El trono o cátedra de San Pedro es la reliquia mas visitada de la Iglesia.

En 1968 los científicos descubrieron que la madera de que esta hecho databa de varios siglos después del nacimiento de Jesucristo. (San Pedro fue crucificado en Roma hacia el 64 o 65 d. C). El antiguo trono de madera fue encajado en un ostensorio barroco de bronce y puede verse en el ábside o tribuna de la basílica, detrás del altar. Además del trono, el templo tiene otras tres reliquias notables, la lanza que atravesó el costado de Jesucristo, un trozo de madera de la Vera Cruz y el velo de la Verónica que enjugó el semblante de Cristo.

La Pietá es la única escultura que firmó Miguel Angel. 

La famosa escultura de Miguel Ángel llamada la Pietá, que representa a Cristo difunto sobre las rodillas de su madre y adorna la primera capilla a la derecha según se entra en la basílica de San Pedro, es la única obra firmada por su autor. El joven escultor, a sus 22 años por aquel entonces, se enteró de que un par de viajeros había atribuido su obra maestra a un artista de tercer orden oriundo de Lombardía. Furioso, una noche se coló en el interior del templo y a la luz de unas velas esculpió en la banda diagonal de cruza el torso de la Virgen unas letras que dicen: MICHAEL ÁNGELUS BONAROTUS, FLORENT. FACIENBAT, es decir, la hizo Miguel Ángel Buonarotti, florentino.

El proyecto dela escalinata de la basílica de San Pedro

Aunque muchos de sus visitantes no lo saben, la escalinata por donde se accede a las puertas se basó en una idea y proyecto de Miguel Ángel. Las estatuas que la flanquean en su parte baja estaban previstas para la basílica de San Pedro Extramuros, que se hallaba en reparaciones cuando la esculpieron. Realizadas en 1838, en 1847 fueron ubicadas definitivamente en San Pedro por una disposición del papa Pío IX.

Venganza de Miguel Ángel de un valido papal

En el Juicio Final, la obra maestra de Miguel ángel en la Capilla Sixtina, el artita dejó una maravillosa chanza oculta. Mientras andaba ocupado con colosal obra, Miguel Ángel recibió una reprimenda por parte de Biagio da Cesena, maestro de ceremonias papal, a cuenta de que había pintado demasiados desnudos, Miguel Ángel se vengó pintando el retrato de Biagio en un rincón, completamente desnudo y además provisto de unas orejas de burro.

El escultor que creó la estatua de San Pedro

 Ha sido un enigma hasta épocas recientes, en que ha sido posible resolverlo por procedimientos de análisis técnico y químico. Se ha determinado que el creador de la estatua fue Arnolfo de Cambio, maestro florentino, el mismo que realizó la decoración interior de la catedral de Florencia, y que la estatua se esculpió en el año 1300.